この「small fraction」は「tip of the iceberg」または「small portion」という意味ですよね。では、「big fraction」という言い回しもあるのでしょうか。

この表現は一般的ですか？

「is that unheard of」は一般的な表現ではありませんが、「unheard of」は一般的な表現です。何かが「unheard of」だというのは、それが新しい、前例のない、奇妙な、あるいは馴染みのないものだということです。 例: Eating dessert before dinner is unheard of.（夕食の前にデザートを食べるなんて前代未聞です）

彼はなぜこのように単語を並べているのでしょうか。

彼は質問とその順番を全て記憶しているので、パフ先生に質問させることなく全ての問いに答えているのですね。これはスポンジボブがこの口頭試験を何度も受けたことがあり、その経験から質問を記憶していることを示しています。

spittin' image of someoneは誰に似ているという意味ですか？

Spittin' image of someone（またはspitting image）は、その人が誰かととても似ているということです。子供が親に似ているように、人と人が似ていると言う時や物に対しても良く使用する表現です。 例：His children are the spitting image of him.（彼の子供は彼にそっくりだ。） 例：The style of the home is the spitting image of an Italian villa. （この家のインテリアはイタリアのvillaに似ているね。）

この場合のweは、シェルドンとメアリーのことですか？それとも、メアリーとペニーのことですか？

ここでの「We」はSheldonとAmyのことです。このように「we」使う場合、一般的に話し手と話し手が話している相手のことを指していることになります。

「made it to」の意味を教えてください。

「made it to」とは、場所に到着する、目標を達成するという意味です。「made」は「make」の過去形です。 例: I hope to make it to Paris by next year.（来年までにパリに行きたいな。） 例: She made it to the end of the book.（彼女は本を最後まで書き上げた。）